Melkkefir is rijk aan nuttige bacteriën, calcium, eiwitten en vitamine B12. Een van de voordelen van deze drank is dat het weinig lactose bevat, dat wordt omgezet in melkzuur en intoleranties voorkomt. Daarnaast bevatten kefirkorrels ongeveer 400 miljoen micro-organismen per gram, waarvan meer dan de helft Lactobacillus-bacteriën zijn.
Kefir helpt bij het herstel van de darmflora en is effectief tegen indigestie, candidiasis, constipatie en diarree, maar stimuleert ook de afweer van het lichaam.