Voetwratten zien er meestal uit als verharde, ronde, licht verhoogde plekjes op de huid. Een kenmerk dat ze onderscheidt van eeltplekken is de aanwezigheid van kleine zwarte puntjes in de wrat. Dit zijn kleine, gestolde bloedvaten.
Ook de manier waarop de pijn wordt ervaren, kan helpen om het verschil te zien. Eeltplekken doen meestal pijn bij directe druk van bovenaf, terwijl voetwratten vaak meer pijn doen bij druk van de zijkanten, waardoor een gevoel ontstaat dat dieper in de voet lijkt te zitten. Ook de locatie kan verschillen: eeltplekken verschijnen meestal op plekken met veel wrijving, zoals de hiel of de randen van de tenen, terwijl voetwratten vaak op specifieke plekken op de voetzool of tussen de tenen voorkomen.
