De autoriteiten maakten ook bekend dat er geen Amber Alert was uitgegeven voor Johnathan toen hij vermist raakte, omdat er onvoldoende bewijs was dat het kind was ontvoerd, zoals wettelijk vereist is.
Jonathan’s vader, de 40-jarige Jameson Kyle Boley, werd tijdens de zoektocht naar zijn zoon gearresteerd op beschuldigingen die geen verband hielden met de verdwijning.
Onderzoekers vonden grondstoffen op het terrein van Boley, wat leidde tot zijn arrestatie op beschuldiging van het illegaal vervaardigen van een vernietigend apparaat. Volgens de districtsrechtbank van Walker County wordt Boley beschuldigd van het bezit van stoffen met de bedoeling om op illegale wijze een vernietigend apparaat of bacteriologisch wapen te vervaardigen.